上海社会科学院宗教研究所成立于1980年。数十年来，全体科研人员坚持马克思主义宗教观指导，坚持理论联系实际，坚持问题导向，积极开展佛教、道教、天主教、基督教、伊斯兰教，以及新兴宗教、民间信仰等领域的研究，在不断完善学科体系过程中形成研究特色。

 上世纪80、90年代，在老一辈学者罗竹风、萧志恬倡导下，以“社会主义社会的宗教问题”为主攻方向，出版《中国社会主义时期的宗教问题》，为本所奠基之作。嗣后，本所科研人员在宗教学理论、宗教史以及教别研究等领域，发挥所长，潜心科研，先后获得国家“七五”重点项目，以及多项一般项目、青年项目等。

进入21世纪，尤其是近年来，宗教研究所贯彻“双轮驱动、提质增效”的办院方针，依托本院学科建设、创新工程（一、二轮），以及国家高端智库等重要学术平台，加强梯队建设、提高科研绩效。在学科建设方面，承担国家重大项目《宗教渗透与国家意识形态安全》、重点项目《长三角流动穆斯林与伊斯兰教研究》，以及《上海基督教史》等，近五年承担国家一般项目2项、青年项目2项、国家重大课题子课题1项，以及3项上海市哲社项目，获得上海市哲社各类奖项5项。在智库建设方面，宗教研究所加强与政府各部门之间的合作，为提高我国宗教工作法制化水平、坚持我国宗教中国化方向，提供学术支持，近年有多份专报获领导批示。本所设“宗教学”、“宗教史”、“当代宗教”三个研究室。1989年创办学术季刊《当代宗教研究》（内刊）。

现有在职员工23人，其中行政管理人员2人、研究员2人、副研究员6人。

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